Η διερεύνηση του SARS-CoV-2 στα λύματα έχει εφαρμοσθεί, σε περισσότερες από 3.892 περιπτώσεις σε 70 χώρες ή περιοχές, επειδή αυτή η προσέγγιση είναι ένας γρήγορος και οικονομικά αποδοτικός τρόπος παρακολούθησης των εστιών COVID-19. Ωστόσο, αυτές οι δοκιμασμένες τοποθεσίες συγκεντρώνονται κυρίως σε πολυπληθέστερες κοινότητες, πανεπιστήμια και συγκοινωνιακούς κόμβους.
Συγκεκριμένα, η επιτήρηση των παθογόνων παραγόντων, ιδιαίτερα των ζωονοσογόνων, στα λύματα από κτηνοτροφικές εκμεταλλεύσεις, είναι ιδιαίτερα σημαντική. Οι κτηνοτροφικές εκμεταλλεύσεις είναι δεξαμενές και τόποι ενίσχυσης μολυσματικών παραγόντων, συμπεριλαμβανομένων των ζωονοσογόνων παθογόνων. Μελέτες έχουν δείξει ότι περίπου το 77% των παθογόνων μικροοργανισμών των ζώων μπορεί να μολύνει πολλά είδη ξενιστών, συμπεριλαμβανομένων της άγριας ζωής και του ανθρώπου.
Τα λύματα σε αυτές τις περιοχές, περιέχουν μικρόβια από διάφορα ζώα. Η δειγματοληψία αυτών των λυμάτων για σκοπούς δοκιμής ή αρχειοθέτησης πριν από περαιτέρω καθαρισμό ή απόρριψη σε δημοτικούς υπονόμους ή ποτάμια είναι απαραίτητη για την υποστήριξη μεγάλης κλίμακας εφαρμογής του WBE(wastewater pathogen surveillance).
Οι πιθανές πηγές μελλοντικών επιδημιών ή πανδημιών περιλαμβάνουν ιούς, βακτήρια, μύκητες και παράσιτα. Τα βακτήρια αντιπροσωπεύουν το 54% και οι ιοί το 25%, από τα 400 περιστατικά αναδυόμενων μολυσματικών ασθενειών που έχουν καταγραφεί από το 1940. Οι εστίες που προκαλούνται από πρωτόζωα (11%) και μύκητες (6%) είναι λιγότερο συχνές.
Αν και εξακολουθούν να εξελίσσονται ταχέως, οι τρέχουσες μη στοχευμένες προσεγγίσεις μπορούν ήδη να παρέχουν ολιστικές γνώσεις για τις μικροβιακές κοινότητες στα συστήματα αποχέτευσης.
Τα δεδομένα που δημιουργούνται από αυτές τις μεθόδους θα μπορούσαν να χρησιμοποιηθούν για τον προσδιορισμό της γενετικής εξέλιξης πολύπλοκων παθογόνων, της δομής του πληθυσμού και της ταυτοποίησης νέων παθογόνων. Ως εκ τούτου, το WBE στις κτηνοτροφικές εκμεταλλεύσεις είναι ιδιαίτερα σημαντικό για τον εντοπισμό πρώιμων προειδοποιητικών σημείων και την ανίχνευση προέλευσης αναδυόμενων και επανεμφανιζόμενων ασθενειών.
Η επιτήρηση των παθογόνων λυμάτων σε περιβάλλοντα ζώων με υψηλές ποσότητες ανθρώπινης δραστηριότητας, μπορεί επίσης να παράσχει έγκαιρα προειδοποιητικά σημάδια και να ενισχύσει την ιχνηλασιμότητα των μολυσματικών ασθενειών, γεγονός που θα μπορούσε να επιταχύνει τον μετριασμό των κινδύνων για τη δημόσια υγεία που σχετίζονται με ζωονοσογόνους παθογόνους.
Συμπερασματικά, η επιτήρηση των παθογόνων παραγόντων των λυμάτων στο πλαίσιο του πλαισίου One Health, είναι απαραίτητη για την πρόληψη καθώς και έγκαιρη αντιμετώπιση των μελλοντικών πανδημιών.
